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當前熱訊:多場景布局三代測序,貝瑞基因要“一鍵解決”單基因全病種檢測

2022-07-01 06:56:15來源:36kr

下一站應用場景是“一鍵解決”單基因全病種檢測。

近日,山東省藥械集中采購平臺一則公告,讓SMA再度進入大眾視野。公告顯示,SMA口服藥利司撲蘭主動申請降價,調(diào)整后價格為每瓶1.45萬元。按年齡體重計算,價格調(diào)整后最大使用劑量患者年治療費用將低于45萬元。據(jù)了解,利司撲蘭今年將繼續(xù)參與國家醫(yī)保談判。而就在去年年底,經(jīng)歷談判代表的“靈魂砍價”,用于治療SMA的“天價藥”諾西那生鈉注射液納入國家醫(yī)保,每支價格從70萬元直降到3.3萬元,一時引發(fā)熱議。

SMA即脊髓性肌萎縮癥(Spinal Muscular Atrophy),是一類由脊髓前角運動神經(jīng)元變性導致肌無力和肌萎縮的遺傳性肌肉疾病。SMA為嬰幼兒中第二常見的致死性常染色體隱性遺傳病,人群攜帶率為1/72-1/47,發(fā)病率為1/10000-1/6000。雖然SMA治療藥物已納入醫(yī)?;蛘诜e極進入醫(yī)保的路上,但其終生治療費用對大部分家庭而言,仍然十分昂貴,且患者的治療為修正治療而不能根治。因此,SMA攜帶者篩查才是最有效的應對方式。


(資料圖片僅供參考)

有研究表明,三代SMA(基于三代測序)是相比qPCR、MLPA等傳統(tǒng)檢測方法,對遺傳病的覆蓋更全面,檢測更精準,有重大應用價值。今日,貝瑞基因向外界公布了三代科研的最新進展:由公司參與完成的三代SMA(脊髓性肌萎縮癥)臨床回顧性研究成果,已近期發(fā)表于分子診斷領域權(quán)威國際學術期刊Journal of Molecular Diagnostics(即時IF=5.568)。

據(jù)介紹,SMA攜帶者分三種情況:91-94%的攜帶者只有一個正常功能的SMN1拷貝(1+0),2-5%的攜帶者含有兩個SMN1拷貝,但其中一個包含致病點突變(1+1D),另外4%為沉默型攜帶者,即有兩個SMN1拷貝,但都位于同一條染色體上(2+0)。目前qPCR、MLPA等傳統(tǒng)基因檢測方法無法檢測1+1D和2+0攜帶者,殘余風險最高可達1/415(1/1245-1/415)。

貝瑞基因三代事業(yè)部總監(jiān)任志林表示,三代測序具有超長讀長、無GC偏好、對高度重復等復雜區(qū)域也能夠準確測序等技術優(yōu)勢,且技術成本持續(xù)下降,2025年將實現(xiàn)與二代測序成本持平。在此基礎上,貝瑞基因開發(fā)出三代SMA基因全面檢測(Comprehensive analysis of SMA, CASMA)技術,可實現(xiàn)SMN1及SMN2基因近30kb全長序列的高效率三代HIFI測序。CASMA還能同時檢測SMN1及SMN2基因拷貝數(shù)、全基因范圍內(nèi)致病性SNVs及Indels,并主動提示沉默型“2+0”的攜帶風險。

此次三代SMA回顧性臨床研究,CASMA一次性精準檢測所有337例樣本的SMN1及SMN2基因拷貝數(shù),對SMN1拷貝數(shù)缺失的檢測靈敏度高達100%。CASMA還成功檢測出4例會被qPCR、MLPA等傳統(tǒng)方法漏檢的SMN1基因點突變攜帶者(1+1D)。通過專利分析方法,CASMA直接預測出全部7例(來自4個家系)已知“2+0”型攜帶者。數(shù)據(jù)顯示,CASMA能大大改善SMA患者基因診斷及預后判斷,提高SMA新生兒基因篩查效率,將攜帶者檢出率從91-94%提高到98%以上,將殘余風險降低4-5倍。

據(jù)介紹,三代SMA只是貝瑞基因三代測序臨床轉(zhuǎn)化體系中的一塊拼圖,無論是科研還是產(chǎn)品落地,都遠遠不止于此:不久前,由貝瑞基因提供技術支持的三代CAH(先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥)臨床回顧性研究成果,發(fā)表于檢驗醫(yī)學領域權(quán)威國際學術期刊Clinical Chemistry(即時IF=11.784);更早一些,2021年上半年,公司發(fā)起了地中海貧血基因圖譜(TiGA)計劃。2021年7月,由貝瑞基因提供技術支持的三代地貧多中心臨床前瞻性研究成果在The Journal of Molecular Diagnostics上發(fā)表。

截至目前,貝瑞基因已將三代測序技術觸達多種罕見病,三代地貧、三代CAH、三代SMA等產(chǎn)品相繼落地。其中,三代地貧檢測試劑盒近期取得醫(yī)療器械注冊倫理批件,進入臨床試驗階段。三代CAH和三代SMA技術則在2022年雙雙取得發(fā)明專利證書。

至于三代測序的下一站應用場景,貝瑞基因表示,是要“一鍵解決”單基因全病種檢測。根據(jù)貝瑞基因官方介紹,因為公司的各種產(chǎn)品是高度兼容,所以更容易實現(xiàn)一次性解決多種疾病,而從一到多,準確性不會受到影響。

“根據(jù)貝瑞基因目前的發(fā)展策略,是在三代測序儀上開發(fā)單病的復雜結(jié)構(gòu)基因突變或者基因結(jié)構(gòu)導致的單病一次性測定方法和試劑盒;未來則是隨著臨床的驗證和市場的接受,逐漸將這些單一產(chǎn)品打包整合,讓越來越多的疾病納入到二代和三代的平臺上,形成一套有效的、能一次性測定指定病種致病基因情況的產(chǎn)品?!?/p>

任志林解釋到,其實大部分人在年輕時候都沒有什么遺傳病表型,但也都會面臨一定的風險,對于每個個體來說,如果把全基因組做了,風險基本上接近100%。“也就是說,每個人都或多或少會有一些致病基因的攜帶情況,只不過因為孟德爾遺傳,同一個致病基因在配偶身上同時攜帶的概率低,但一旦懈怠這個致病基因,就存在25%的生育下一代患兒的風險?!?span style="letter-spacing: 0px;">從疾病自身的角度來說,CAH、地貧、FXS、SMA等,單病發(fā)病風險并不高,但在生育過程中,夫妻雙方單個人攜帶的風險其實是很高的,這也是治病基因攜帶者篩查市場的需求高漲的關鍵原因。

他也指出,目前在市場供給端方面,大陸地區(qū)還沒有特別成熟的實際應用。在貝瑞基因看來,未來最大的應用場景還是攜帶者篩查,隨著數(shù)據(jù)量越來越大,得到更廣泛的臨床認可,市場也將迎來爆發(fā)。

關鍵詞: 治療費用 提供技術 國際學術期刊

責任編輯:hnmd004

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